Gene Set Enrichment Analysis (Part 1)
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Bioinformatics/Pathway Analysis
`GSEA` 포스팅은 총 3가지 파트로 이루어져 있습니다. 이번 파트에서는 이론적인 배경과 수식의 전개를 확인하며, `Part 2`에서는 스크래치부터의 구현, 그리고 마지막 `Part 3`에서는 실제 자료를 통해 pathway 분석을 진행해보겠습니다.Gene Set Enrichment Analysis`Gene Set Enrichment Analysis (GSEA)`는 `In Silico``pathway` 분석 기법으로, `microarray`나 `RNA-seq` 자료를 통해 특정 `gene set`이 관심있는 `표현형`과 얼마나 연관성이 있는지 확인하는 통계적 기법입니다. 여러 전통적인 기법과`PAEA`와 같은 새로운 방법의 검정법 등이 논문에 많이 그리고 새로이 등장하고 있습니다. 그 중 `GSEA`는..